Фамилия Кардыкова, скорее всего, женская форма от Кардыков, а та, в свою очередь, восходит к прозвищу Кардык. В основе лежит тюркское слово «кардык» или «кардак», которое в разных диалектах означало «сородич», «родственник», «брат» (от общетюркского «кардаш»). Прозвище Кардык могли дать человеку, который выделялся крепкими родственными связями, был заступником за свой род или, наоборот, пришёл из другой семьи и был принят как «свой». Встречается также вариант, что «кардык» — это местное диалектное название растения (например, чертополоха), но эта версия менее вероятна: прозвища по растениям обычно образовывались от названий, более распространённых в русской среде.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий как притяжательных прилагательных: «чей?» — Кардыков, то есть сын или потомок Кардыка. Форма Кардыкова — это либо жена Кардыкова, либо дочь в семье Кардыковых. В русской традиции фамилии на -ов/-ев чаще всего получали крестьяне и мещане, реже — духовенство и дворянство. Сословная принадлежность Кардыковых могла быть разной, но прозвищное происхождение намекает на крестьянскую или посадскую среду.

Географически фамилия встречается в Поволжье и на Урале — регионах, где исторически было сильное тюркское влияние. Это косвенно подтверждает тюркскую основу: в этих местах русские фамилии нередко вбирали в себя слова соседних народов. Стоит отметить, что ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог — Карды́кова, хотя в некоторых говорах могло сместиться на последний.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями (Кардаков, Кардашов, Кардашев), то Кардыков выделяется именно усечённой формой — без суффикса -аш. Это редкий случай, когда тюркское «кардаш» потеряло конечный согласный, что могло произойти при устной передаче прозвища в русской среде. Такая особенность делает фамилию не просто «братской», а указывает на конкретный диалектный или семейный вариант произношения.