Фамилия Каркаускас — литовский вариант польской фамилии Каркавский или Карковский. В Литве её переоформили по местной модели: добавили типичный литовский суффикс -auskas, который часто заменял польское -owski. Так польский шляхтич или мещанин из Карнково (или Карково) становился Каркаускасом.

Сама польская основа уходит к названию селения Карнково (Карково) в Польше. Фамилию давали тому, кто оттуда родом, — типичная практика для польской и литовской знати. Но есть и другая версия: прозвище могли образовать напрямую от польского kark («затылок, шея, загривок»). Тогда Каркавский — человек с крупной головой или мощной шеей, что бросалось в глаза.

Третий вариант — от глагола karkać («каркать»). Здесь прозвище получал обладатель громкого, резкого голоса, напоминающего воронье карканье. Такие прозвища давали не в обиду, а как меткую бытовую характеристику.

Из трёх версий самая надёжная — топонимическая: фамилия происходит от названия села. Связь с конкретным местом встречается в польских фамилиях на -овский чаще, чем прозвища по внешности или голосу. Однако исключать kark или karkać тоже нельзя — в Литве и Польше прозвищные фамилии не редкость.

Литовский суффикс -auskas указывает, что носитель фамилии жил на территории бывшего Великого княжества Литовского, где польские фамилии адаптировали под местное произношение. Каркаускас — не единичный случай: похожим образом появились Яблонскас, Ковальскас, Садовскас.