Фамилия Карнюхин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Карнюхин послужило имя Корнюха. Фамилия Карнюхин образована от крестильного имени Корнелий (в переводе с латинского языка – «рог»). В основе фамилии лежит его просторечная форма Корнюха. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Корнюха, со временем получил фамилию Карнюхин. О точном месте и времени возникновения фамилии Карнюхин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Карнюхин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.