Фамилия Карпиленко имеет украинские корни, на что указывает суффикс –ЕНКО. Существует две версии ее происхождения. По одной из них, эта фамилия образована от мирского имени Карп, данного по названию рыбы. Согласно другой версии, в основе фамилии лежит каноническое мужское имя Карп (от греческого “karpos” – “приносить пользу”).