Фамилия Кайнинан — редкий пример фамилии, которая почти наверняка не русская по происхождению, а финно-угорская или карельская. Её основа и суффикс не вписываются в типичные славянские модели на -ов, -ин или -ский, что сразу указывает на иную языковую среду. Скорее всего, перед нами фамилия, принесённая на русский Север переселенцами из Финляндии, Карелии или Ингерманландии.

Разбираем слово. Корень «Кайн-» (Kain-) в финском и карельском языках имеет несколько значений. Самое вероятное — от слова «kainalo» (подмышка, пазуха) или «kainu» (отдалённый, глухой). В топонимике известен регион Кайнуу (Kainuu) в Финляндии, название которого связывают с «глухой землёй» или «низиной». Таким образом, прозвище Кайна (Kaina) могло означать человека из этой местности — выходца из Кайнуу, либо указывать на его характер: замкнутый, живущий в глуши. Суффикс «-нен» (в русской записи «-нан») — один из самых распространённых в финской ономастике, он означает «принадлежащий к», «из рода». Кайнинан, по-фински Kaininen, — это «из рода Кайна» или «человек из Кайнуу».

Встречается фамилия и в более редком варианте — Кайнинен, что одно и то же, просто разная передача финского «-nen» на русский. Географически фамилия Кайнинан зафиксирована в основном на северо-западе России: в Ленинградской области, Карелии, а также среди ингерманландских финнов, которых в XVII–XVIII веках переселяли на эти земли. В метрических книгах и переписях XIX века такие фамилии нередко записывали на слух, поэтому возможны искажения вроде Кайнинов или Кайнанов, но исходная форма — именно с финским суффиксом.

Владельцы фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками из финских или карельских общин. Никаких дворянских родов с такой фамилией не известно — она бытовая, народная, без гербов и титулов. Единственное, что можно добавить: в XX веке, после советско-финских войн и депортаций, многие носители финских фамилий сменили их на русские или были ассимилированы, поэтому Кайнинан — сегодня редкость, но ценная.