Фамилия Кайнихин — редкий случай, когда суффикс подсказывает регион, а основа ставит в тупик. Модель образования здесь нестандартная для русских фамилий: суффикс -ихин встречается реже привычных -ов или -ин. Он характерен для северных и сибирских говоров, где фамилии на -ихин и -ыхин указывали на принадлежность к роду или семье: «чей?» — «Кайнихин», то есть «из семьи Кайнихи». Это отчество второго порядка, образованное от прозвища или имени Кайниха.

С основой сложнее. Корень Кайн- не имеет однозначного толкования в русском языке. Самая вероятная версия — тюркское происхождение. В татарском, башкирском и казахском языках слово «кайн» (ҡайын) означает «береза» или «родственник со стороны жены» (кайнага — зять, кайны — свояк). Прозвище Кайниха могли дать человеку, который был связан с берестяным промыслом, жил у березовой рощи или получил имя по родству через брак. Вторая, менее правдоподобная версия — от диалектного глагола «кайнить» (шуметь, скандалить), но такая форма не зафиксирована в словарях.

Географически фамилия привязана к Уралу и Западной Сибири. По данным переписей XIX века, носители Кайнихиных встречались в Пермской губернии, среди крестьян и заводских работников. Суффикс -ихин там был обычен: ср. Кайгородов — Кайгородихин, Глухих — Глухихин. То есть предок Кайнихиных, скорее всего, был небогатым человеком, которого в документах записали по уличному прозвищу или отцовскому имени.

Спорных версий немного. Иногда Кайнихина пытаются связать с немецким Kain (Каин), но это натяжка: фамилия не встречается в немецких колониях, а суффикс -ихин чисто русский. Также есть гипотеза о финно-угорской основе (кайна — «заяц» в коми), но она не подтверждена статистикой — в коми-пермяцких фамилиях чаще встречаются окончания -ев, -ов. Правдоподобнее всего тюркский след: в XVI–XVII веках на Урал переселялись татары и башкиры, чьи имена русифицировали, добавляя суффиксы. Так Кайныха мог превратиться в Кайнихина.

Таким образом, Кайнихин — фамилия-отчество с четкой региональной окраской. Ее носитель — потомок человека, которого в уральской деревне звали Кайнихой, а то имя, в свою очередь, скорее всего, указывало на тюркские корни или местную природную особенность.