Фамилия Канихин — одна из тех, что ставит перед исследователем загадку: с первого взгляда кажется, что корень ясен, но при ближайшем рассмотрении оказывается, что трактовок может быть несколько. Модель образования здесь стандартная: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Канихин — это сын или потомок человека по прозвищу Каниха. Вопрос в том, что это за прозвище.

Самая прямая и географически обоснованная версия отсылает к южнорусским говорам. В курских, орловских, воронежских диалектах «каниха» — это женщина, которая любит попрошайничать, клянчить, выпрашивать. Слово происходит от глагола «канить» (просить, докучать). Соответственно, прозвище Каниха могли дать либо капризному, плаксивому ребёнку, либо взрослому человеку с назойливым, приставучим характером. Фамилия Канихин в этом случае — «сын Канихи», и она вполне логично вписывается в ряд прозвищных фамилий, образованных от женских прозвищ (вроде Бабихин, Марьихин).

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование, связывает фамилию с тюркским корнем «каны» (кровь, родня). Однако для русского суффикса -ин такая основа нехарактерна: фамилии от тюркских имен обычно оформляются через -ов/-ев (Канышев, Канаев). К тому же форма «Канихин» звучит как чисто славянское образование, а не как тюркская фамилия, русифицированная на ходу.

Стоит обратить внимание на то, что фамилия встречается редко и имеет локальный характер. По данным открытых источников, основные очаги фамилии Канихин — это Центральное Черноземье (Воронежская, Липецкая области) и юг России. Это косвенно подтверждает диалектную версию: именно там слово «каниха» было в ходу. В северных и сибирских регионах фамилия почти не встречается.

Таким образом, с высокой долей вероятности, Канихин — это потомок человека, которого в деревне прозвали Канихой за навязчивость или плаксивость. Фамилия недворянская, крестьянская, скорее всего, поздняя (XVII–XIX века), когда прозвища окончательно закреплялись как наследственные. Никаких известных исторических деятелей с этой фамилией в открытых источниках не зафиксировано, что только подтверждает её простонародное и локальное происхождение.