Фамилия Кайргали — редкий пример, где за привычным русским окончанием стоит тюркское имя, а не прозвище или профессия. Основа здесь — мужское личное имя Кайргали, которое пришло из тюрко-татарской ономастики. Оно составное: первая часть «Кайр» (или «Кайыр») восходит к арабскому «хайр» — «благо, добро, добрый поступок». Вторая часть — «гали» (от арабского «али» — «высокий, возвышенный, великий»). В сумме имя можно истолковать как «великое благо» или «высокое добро», что характерно для мусульманских имён-композитов, где родители желали ребёнку счастливой и достойной судьбы.

Фамилия образована по типичной для русской среды модели: к тюркскому имени добавили нулевой суффикс, и в итоге мы имеем форму, которая закрепилась без дополнительных русских окончаний (-ов, -ев, -ин). Это указывает на то, что носители фамилии, скорее всего, были крещёными татарами, башкирами или представителями других тюркских народов, перешедшими в православие, но сохранившими родовое имя в качестве фамилии. В таких случаях фамилию часто записывали «как слышали», без переделки на русский лад.

Географически фамилия Кайргали встречается в основном в Поволжье и Приуралье — регионах, где веками шло смешение славянского и тюркского населения. Встречаются варианты написания: Кайргалиев, Кайргалин — они показывают, как имя постепенно адаптировалось под русскую грамматику (суффикс -ев указывает на принадлежность роду). Однако форма без суффикса — самая старая и редкая.

Спорных версий у фамилии почти нет: корень прозрачен, а арабская этимология не вызывает сомнений у ономастов. Её уникальность — в том, что она сохранила исходное имя почти без изменений, в отличие от большинства тюркских фамилий, которые русифицировались через суффиксы. Предки носителя этой фамилии, вероятно, были сельскими жителями, крестьянами или мещанами, а само имя давалось в честь религиозного понятия, подчёркивая благочестие семьи.