Фамилия Каюсов — один из тех случаев, когда за простой на первый взгляд основой скрывается историческая загадка. Разобраться в её происхождении мешает редкое имя Каюс, которое могло попасть в русский быт разными путями. Самая прямая версия связывает его с церковным именем Гай. Каюс в этом случае — не самостоятельное имя, а диалектная или народная форма, возникшая в устной речи. Само имя Гай латинского происхождения и переводится как «радость» или «удовольствие». В Новом Завете так звали нескольких персонажей: Гая Македонянина, спутника апостола Павла, и Гая, любимого ученика апостола Иоанна. Значит, в основе фамилии лежит крестильное имя, а суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Каюса» или «из рода Каюса».

Однако есть и другая, менее очевидная версия. Согласно ей, Каюс — это не имя, а прозвище, причём, возможно, немецкого происхождения. Оно могло восходить к названию местности Kues (Кус) на берегу реки Мозель, протекающей по территории Франции, Люксембурга и Германии. Немецкое прозвище Каус или Каюс давали уроженцу этих мест. Само название Kues, в свою очередь, выводят из позднелатинского covis — «сарай» или «конюшня». Если принять эту версию, то фамилия Каюсов оказывается не «именной», а «топонимической»: она закрепилась за потомками человека, которого прозвали по месту его рождения.

Какая из гипотез правдоподобнее? Для русского ономастикона модель «имя → фамилия» встречается гораздо чаще, чем заимствование прозвища по немецкому топониму. Поэтому версия с крестильным именем Гай выглядит более естественной. Впрочем, редкие немецкие заимствования в русских фамилиях тоже известны, особенно в тех регионах, где были контакты с немецкими колонистами или Прибалтикой.

В документах фамилия встречается редко. Так, в Книгу памяти Свердловской области внесён Каюсов Александр Иванович, родившийся в 1899 году в Великолукском уезде Псковской губернии. Эта запись — одно из немногих реальных свидетельств бытования фамилии в дореволюционной России. Псковская губерния не была зоной компактного расселения немцев, что косвенно поддерживает версию о русском происхождении фамилии от имени Гай.