Фамилия Казакбаев образована от тюркско-татарского имени Казакбай. Оно состоит из двух компонентов: «казак» - «военный всадник, кавалерист, солдат», «вольный поселенец на окраине русского государства (долина Дона, Урала, Запорожье)» и «бай» - «хозяин; состоятельный, влиятельный человек, господин».