Фамилию Керзин чаще всего связывают с тюркскими корнями, а точнее — с прозвищем Керзя или Керза. В основе лежит диалектное слово «керз» или «керза» — так в некоторых тюркских языках называли грубую, жесткую шерстяную ткань или войлок. Прозвище Керзя могли дать человеку, который торговал такой тканью, изготавливал её или носил одежду из нее. В переносном смысле так могли прозвать упрямого, «жёсткого» по характеру человека — похоже на то, как в русском языке слово «сермяжный» стало обозначать не только одежду, но и простоватый склад характера.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Керзин — это «сын Керзи» или «человек из рода Керзи». Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на гласный (ср. Птицын от Птица, Репин от Репа). В русском ономастиконе фамилия Керзин встречается нечасто, что говорит о её локальном происхождении — скорее всего, в районах Поволжья, Урала или Сибири, где было сильное тюркское влияние и контакты с татарами, башкирами или казахами.

Есть и другая, менее правдоподобная версия: от старого русского слова «керза» — так в некоторых говорах называли засохшую грязь или корку на теле. В этом случае прозвище могло быть насмешливым, но такая этимология не подкрепляется авторитетными словарями и встречается только в любительских изысканиях. Скорее всего, это народное переосмысление уже готовой фамилии.

Судя по фамильной модели, предки Керзиных не были дворянами — фамилия не получила распространения в высших сословиях. Носители её, вероятно, относились к крестьянам или посадским людям, а первым Керзиным мог быть выходец из татарской или башкирской среды, принявший православие. В дореволюционных метрических книгах фамилия фиксируется в Пермской и Вятской губерниях — это подтверждает урало-прикамский ареал.

Сегодня фамилия остаётся редкой. Встретить Керзина можно скорее в Пермском крае, Кировской области или у потомков уральских старообрядцев, переселившихся в Сибирь.