Фамилия Хабдулова — редкий пример фамилии, образованной от мусульманского имени через тюркскую фонетику и русский суффикс. В основе лежит арабское имя Абдулла (или его вариант Абдалла), что значит «раб Аллаха». Начальное «Х» появилось из-за особенностей произношения в казахском, башкирском или татарском языке: звук «А» в начале имени под влиянием гортанного призвука перешёл в «Ха». Так имя Абдулла превратилось в Хабдулла, а затем, при добавлении русского суффикса принадлежности -ов (в женском роде -ова), возникла фамилия Хабдулова.

Словообразовательная модель здесь типична для фамилий народов Поволжья и Казахстана: тюркская основа плюс русский суффикс. Мужская форма — Хабдулов. Фамилия указывает на то, что предок носителя был мусульманином и, скорее всего, происходил из среды, где арабские имена адаптировались под местную фонетику — у татар, башкир или казахов. Встречается она преимущественно в регионах с преобладанием тюркского населения: в Татарстане, Башкортостане, в Оренбургской области и в Казахстане.

В ономастике есть и другая версия, менее вероятная: что основа — не имя, а прозвище от тюркского слова «хабдул» (что-то вроде «жадный» или «скупой»). Но большинство исследователей сходятся на том, что перед нами патроним — фамилия, образованная от личного имени. В словарях тюркских фамилий (например, у А. Г. Гафурова) такие переходы «Абдулла — Хабдулла» описаны как регулярный фонетический процесс.

Сословная принадлежность предков Хабдуловых могла быть разной: от крестьян до мелких торговцев или духовных лиц. Фамилия не даёт указаний на дворянство или казачество — она скорее массовая, народная. Её редкость сегодня объясняется тем, что форма Хабдулла менее распространена, чем классическое Абдулла или Абдулов, а значит, носители Хабдуловых — это, скорее всего, потомки одной или нескольких семей, сохранивших местный говор в имени.