Хабдуллин — фамилия, которая сразу выдает тюркские корни, а точнее — казахское или татарское происхождение. Она образована по классической для русской ономастики модели: к тюркскому имени добавили русский патронимический суффикс -ин. В основе лежит арабское имя Абдулла (в тюркской огласовке — Хабдулла, где начальное «Х» — результат местного произношения), что значит «раб Аллаха», «слуга Божий». Такие имена широко распространены у мусульманских народов, и фамилия Хабдуллин буквально означает «сын Хабдуллы» или «потомок Хабдуллы».

Примечательно, что суффикс -ин, а не -ов, не случаен. В русской фамильной системе -ин обычно присоединяли к основам на -а или -я. Имя Хабдулла заканчивается на «а», поэтому логично получилось Хабдуллин, а не Хабдуллов. Это же правило работает с фамилиями Габдуллин, Абдуллин — все они вариации одного корня, различающиеся лишь начальным звуком, который зависел от диалекта или региона. В казахской среде, например, имя чаще звучало как Қабдолла или Хабдолла, отсюда и написание фамилии через «Х».

Географически фамилия Хабдуллин встречается прежде всего в Казахстане, в Оренбургской, Астраханской областях России, а также среди татар Поволжья. Предки носителя этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или скотоводами, но сама фамилия не указывает на сословие — она чисто отчество, и её появление в документах относится к периоду массового закрепления фамилий у тюркских народов в XIX — начале XX века. В отличие от русских крестьян, у казахов и татар фамилии часто фиксировали по имени деда или отца, поэтому Хабдуллин — это прямое указание на имя родоначальника, а не на прозвище или ремесло.

Интересно, что в русских записях фамилию могли записывать по-разному: Хабдуллин, Хабдулов, Кабдуллин — из-за сложности передачи тюркских звуков кириллицей. Но вариант с двумя «л» и окончанием -ин закрепился как основной, поскольку точнее передаёт исходное имя. Если искать однокоренные фамилии, то к этой же группе относятся Абдуллин, Габдуллин, Абдулов — все они восходят к тому же арабскому имени, но через разные диалектные формы.