Фамилия Хабидуллина — женская форма мужской фамилии Хабидуллин, и чтобы понять её происхождение, нужно разобрать именно мужской вариант. Основа здесь — арабское имя Хабидулла (Хабибулла), которое переводится как «любимец Аллаха» (от «хабиб» — любимый, друг и «Аллах» — Бог). Это теофорное имя, то есть содержащее имя Бога, и в мусульманской среде оно давалось с надеждой на особую милость Всевышнего.

Фамилия образована по русской модели с патронимическим суффиксом -ин, который в тюркских и арабо-персидских фамилиях на территории России встречается очень часто. Суффикс -ин указывал на принадлежность: «сын Хабидуллы», «из рода Хабидуллы». Интересно, что здесь мы видим не простое заимствование, а гибрид: арабское религиозное имя + русский способ оформления фамилии, что типично для татарской и башкирской ономастики.

Географически фамилия Хабидуллин (и Хабидуллина) чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской, Челябинской и Самарской областях — регионах с компактным проживанием татар и башкир. Это не дворянская фамилия, а народная, крестьянско-мещанская: её носителями были муллы, ремесленники, торговцы, но чаще всего — земледельцы. В русских метрических книгах XIX века такие фамилии фиксируются поздно, в основном после всеобщей переписи 1897 года, когда крестьянам массово присваивали фамилии по имени отца.

Стоит обратить внимание на орфографический нюанс. Встречаются варианты написания через букву «а» в середине — Хабадуллина, но это, скорее всего, результат диалектного произношения или ошибки писаря. Правильная этимологическая форма — Хабидуллина, с «и» в корне, поскольку арабское «хабиб» даёт именно такой гласный. Впрочем, в быту оба варианта могут сосуществовать, и это не меняет смысла фамилии.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Хабидуллина стоит в одном ряду с Хабибуллиным, Хабибовым и даже Абдуллиным (где «абд» — раб, а не «хабиб»). Разница в первой части имени: Хабидулла — «любимец», а Абдулла — «раб Божий». То есть предки носительницы фамилии Хабидуллина были названы по имени, которое подчёркивало не смирение, а близость и любовь к Богу.