Фамилия Хабдулин — редкий пример того, как тюркское имя, пройдя через русскую фамильную модель, закрепилось в форме, нехарактерной для большинства фамилий на -ин. Обычно суффикс -ин присоединяется к основам на -а/-я (Петров — Петин, Кузьма — Кузьмин), но здесь основа «Хабдул» — усечённый вариант арабского имени Абдулла (раб Аллаха). В тюркских языках, особенно у казахов, башкир и татар, имя часто произносится как Хабдулла или Хабдул — с твёрдым «х» на месте арабского гортанного звука. От него и пошла фамилия: Хабдул + ин, то есть «сын Хабдула».

Географически фамилия тяготеет к Оренбуржью, Башкортостану и Западному Казахстану — регионам, где в XIX веке активно шёл процесс русификации тюркских фамилий. В метрических книгах и ревизских сказках можно встретить варианты написания: Хабдуллин (с двойным «л», более близкий к исходной арабской форме) и Хабдулин — с упрощением. Второй вариант, вероятно, закрепился при записи в русских канцеляриях: чиновник на слух записал имя без удвоения, а потом эта форма перешла в документы.

Что касается значения: Хабдулин — патронимическая фамилия, указывающая на принадлежность к роду человека по имени Хабдул. Сам Хабдул — не каноническое имя, а народная переработка Абдуллы, распространённая среди мусульман Поволжья и Приуралья. Носитель фамилии в прошлом — скорее всего, рядовой крестьянин или казак из башкирских или татарских сословий, так как среди дворянских родов такая фамилия не фиксируется.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на -ов, которые доминируют у русских, форма на -ин у тюркских фамилий встречается реже и часто указывает на более раннюю или более плотную ассимиляцию. Хабдулин — как раз такой случай: основа тюркская, а суффикс — чисто русский, причём не самый типичный для заимствованных имён. Если встретите однофамильца, можно с высокой вероятностью предположить его корни в среде волго-уральских татар или башкир.