Фамилия Хабулина — женская форма, а её основа, мужская фамилия Хабулин, восходит к личному имени Хабула. Это имя — один из вариантов арабского имени Хабибулла, что в переводе означает «любимец Аллаха», «друг Бога». В тюркских языках, особенно у татар и башкир, имя Хабибулла часто сокращалось до более кратких форм: Хабил, Хабул, Хабула. Так что предок носителя этой фамилии, скорее всего, был назван в честь деда или уважаемого человека с таким именем.

Фамилии на -ин, как Хабулин, типичны для восточнославянской модели образования от основ, оканчивающихся на -а, -я. В данном случае к имени Хабула добавился русский патронимический суффикс -ин, означающий «чей?» — то есть «сын Хабулы». Такая гибридная модель (тюркская основа + русский суффикс) характерна для регионов Поволжья и Урала, где веками жили рядом татары, башкиры и русские. Фамилия Хабулина встречается в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях.

Редкость фамилии в том, что она сохранила архаичную форму имени без второго «б» — Хабула вместо более привычного Хабибулла. Это указывает на устную, бытовую традицию передачи имени, где долгие гласные и сложные сочетания стягивались для удобства произношения. Встречаются также варианты написания — Хабуллин, с удвоенной «л», но они менее распространены. Сословно предки Хабулиных могли быть как крестьянами, так и служилыми татарами или башкирами, но точных данных об этом нет — фамилия не была дворянской и не фиксировалась в родословных книгах.