Фамилия Хабуля — редкий пример, где географический и языковой контекст важнее разбора по стандартной русской модели. Она почти не встречается в центральной России, зато устойчиво фиксируется на Северном Кавказе и в Закавказье, особенно у осетин, грузин и народов Дагестана. Это подсказывает, что искать её корни нужно не в славянской ономастике, а в местных языках.

Самый вероятный источник — осетинское или тюркское имя Хабол, Хабла, восходящее к арабскому «хабиб» (любимый, друг) или к тюркскому «кабул» (согласие, принятие). В осетинском языке есть имя Хæбул, которое могло стать прозвищем, а затем и фамилией. Суффикс -я в данном случае не типичный русский уменьшительный, а скорее грузинский или осетинский фамильный формант, адаптированный при записи в русских документах. В грузинском окончание -уля (-ули) часто указывает на принадлежность к роду или местности, и Хабуля могло возникнуть как «из рода Хабула» или «хабульский».

Вторая версия, менее вероятная, но возможная для некоторых регионов Украины или юга России, — связь с диалектным глаголом «хабулить» (брать, хватать, присваивать). В этом случае фамилия могла быть прозвищем жадного или хваткого человека. Однако распространённость фамилии именно на Кавказе делает эту гипотезу спорной: прозвищная модель на -я там встречается редко, а кавказская основа — гораздо органичнее.

Социальный слой носителей фамилии Хабуля, судя по сохранившимся данным XIX — начала XX века, — в основном крестьяне и горцы, без выраженной дворянской прослойки. В метрических книгах и ревизских сказках она встречается в селениях Северной Осетии и Кабардино-Балкарии. Из-за малой распространённости и сильной региональной привязки фамилия почти не меняла написания: варианты Хаболя, Хабулев — это скорее ошибки писцов, чем самостоятельные формы.