Фамилия Хабибудинов — яркий пример того, как русская модель фамилии на -ов накладывается на арабское по происхождению имя, распространённое у тюркских и кавказских народов. В основе лежит мужское личное имя Хабибуддин, которое в свою очередь состоит из двух арабских корней: «хабиб» — любимый, друг, и «дин» — вера, религия. В совокупности имя означает «любимец веры» или «друг религии», что в исламской традиции является почётным и благочестивым именем-пожеланием.

Фамилия образована по стандартной для русской ономастики схеме: к основе Хабибудин добавили патронимический суффикс -ов. Таким образом, Хабибудинов буквально означает «сын Хабибуддина» или «потомок Хабибуддина». Фонетическое упрощение — выпадение одной буквы «д» в середине (Хабибудинов вместо Хабибуддинов) — типично для адаптации длинных восточных имён в русской речи, где стечение согласных «-дд-» не свойственно.

Географически фамилия распространена прежде всего среди татар, башкир, а также у народов Дагестана и других регионов с мусульманской традицией. Встречается и у представителей народов Средней Азии, но там чаще сохраняется исходная форма Хабибуддинов или Хабибуллаев. В русской среде фамилия редкая и почти всегда указывает на восточные корни предка-носителя имени.

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий на -ов, которые в русском языке закрепились ещё в XV–XVII веках, Хабибудинов — образование относительно позднее. Массово такие фамилии появлялись у тюркских народов после вхождения их территорий в состав Российской империи, когда фиксация отчеств и фамилий стала обязательной при переписях и рекрутских наборах. Поэтому предки современных Хабибудиновых, скорее всего, жили в Поволжье или на Урале и получили фамилию не раньше середины XIX века.

Однокоренные фамилии — Хабибуллин, Хабибуллаев, Хабибов — различаются суффиксами, но восходят к тому же корню «хабиб». Вариант с -динов выделяется именно указанием на религиозный аспект имени, что делает его не просто «любимым», а «любимым в вере».