Фамилия Хаматрахимов — один из тех редких случаев, когда основа прозвища или имени почти полностью скрыта за тюркским или арабским влиянием, а суффикс указывает на русский способ оформления фамилии. Разберём её по составу: корень «Хаматрахим» и типичный русский патронимический суффикс «-ов». Суффикс говорит о том, что фамилия образована от имени или прозвища предка по мужской линии: «чей?» — Хаматрахимов, то есть сын (или потомок) Хаматрахима.

Самая вероятная версия происхождения основы связана с арабским именем «Абдуррахман» (عبد الرحمن — «раб Милостивого», то есть раб Аллаха). В тюркских языках, особенно у татар, башкир и народов Северного Кавказа, это имя часто адаптировали, сокращая или меняя звучание. Форма «Хаматрахим» могла возникнуть в результате слияния и редукции: от «Абдуррахман» через промежуточные варианты вроде «Абдрахим» или «Хамрахим». Приставка «ха-» иногда появляется как результат оглушения или диалектного произношения. Таким образом, Хаматрахим — это искажённое, но узнаваемое арабское имя, означающее «слуга Всемилостивого».

Менее правдоподобна, но возможна связь с тюркским словом «хамал» (носильщик, грузчик) или «хаммал» — но тогда в фамилии ожидался бы суффикс «-ов» от прозвища Хамал, а не сложная форма с «трахим». Вряд ли здесь есть и еврейские корни (от «Хаим»), так как суффикс «-ов» и арабская основа указывают на мусульманскую среду.

Географически фамилия Хаматрахимов встречается крайне редко, в основном в Татарстане, Башкортостане и среди татарской диаспоры. Это указывает на то, что предки носителя фамилии, скорее всего, были татарами или башкирами, принявшими русскую модель образования фамилий в XIX веке, когда проводилась массовая фиксация фамилий для мусульманского населения. В отличие от русских крестьян, у которых фамилии часто образовывались от прозвищ по ремеслу, здесь мы видим чисто именную основу — предка звали Хаматрахим, и это имя дали ему родители, вероятно, с религиозным значением.

Сословная принадлежность предков могла быть разной: от крестьян до мелких торговцев или духовных лиц. Но однозначно сказать, кем они были по роду занятий, невозможно — фамилия не содержит указания на профессию. Единственное, что можно утверждать: носитель фамилии — потомок человека с арабо-тюркским именем, которое в русской среде оформилось через патронимический суффикс.