Фамилия Хаматкоев — редкая и географически привязанная к Северному Кавказу, в первую очередь к Ингушетии и Чечне. Её основа — личное имя Хаматко, которое является усечённой формой от арабского имени Хаммат (восходит к «хамид» — восхваляющий) с добавлением вайнахского уменьшительно-ласкательного суффикса -ко. Такой формант характерен для ингушских и чеченских имён и означает «маленький», «младший» или просто придаёт имени оттенок близости: Хаматко — это, по сути, «Хамат» или «Хаммат» в домашнем, обиходном варианте. Русский суффикс -ев, присоединённый к этой основе, оформил фамилию по общероссийской модели: «чей?» — Хаматкоев, то есть «потомок Хаматко».

В ономастике Кавказа такой гибрид не редкость: местное имя или прозвище «обрусевало» при записи в метрики или ревизские сказки. В случае с Хаматкоевыми это произошло, скорее всего, во второй половине XIX века, когда горцев активно вносили в официальные документы. Важно, что фамилия не получила распространения за пределами региона: она практически не встречается в центральной России или Сибири, что подтверждает её локальный и относительно поздний характер.

Словообразовательная модель проста: корень Хамат- + уменьшительный суффикс -ко- + патронимический суффикс -ев. Ударение, судя по живой речи носителей, падает на последний слог: Хаматко́ев. Встречаются варианты написания с одной буквой «к» (Хаматоев), но они ошибочны и возникают из-за упрощения на письме.

Других версий происхождения — например, от тюркского «хамат» (работа) или арабского «хамат» (свёкор) — рассматривать всерьёз не стоит: они не объясняют ни суффикса -ко, ни чёткой привязки к вайнахской антропонимике. Фамилия Хаматкоев — типичный пример того, как местное имя, пройдя через русскую канцелярию, закрепилось в документах и стало родовым знаком для нескольких семей в горной Ингушетии.