Фамилия Ханахбеева — редкий пример фамилии, образованной от тюркского составного имени, в котором соединились арабский и тюркский корни. Первая часть, «Хана», восходит к арабскому «хан» — вождь, правитель, владыка. Вторая часть, «хбе» — это искажённое тюркское «бек» или «бий» (князь, господин). Таким образом, имя Ханакбек (или Ханахбек) буквально означало «правитель среди правителей» или «хан-князь». Это типичный для тюркских народов композит, подчёркивающий высокий статус или почётное прозвище родоначальника.

Суффикс «-ева» указывает на русскую модель образования фамилий от имён на согласный: Ханахбеев — для мужчины, Ханахбеева — для женщины. По происхождению это патронимическая фамилия, то есть «дочь (или жена) Ханахбея». Такая форма закрепилась на Кавказе и в Поволжье, где фамилии часто русифицировали при записи в документах XIX–XX веков. В отличие от многих русских фамилий на «-ов», здесь нет суффикса принадлежности «-ов» в чистом виде: основа имени уже заканчивается на «-бей», и «-ев» просто адаптирует её к русской грамматике.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически жили кумыки, ногайцы, аварцы или другие народы Дагестана и Северного Кавказа. Имя Ханакбек встречается у кумыков и чеченцев, но в форме Ханахбеева чаще встречается у народов, испытавших сильное русское административное влияние. Если искать аналоги, то однокоренные фамилии — Ханахмедов, Ханалиев, Ханакаев — все они строятся по той же схеме: «хан» + тюркское имя или титул.

Интересная деталь: в написании «Ханахбеева» слышен отголосок старых тюркских норм, где имя произносили с гортанным «х» и редуцированным гласным между «н» и «б». В русской записи этот звук исчез, но сохранился на письме как буква «х» после «н» — что необычно для русского языка. Это один из признаков, что фамилия не переводилась, а записывалась на слух, и её носители, скорее всего, были из среды, где двуязычие было нормой.