Фамилия Ханабеева — яркий пример того, как русская словообразовательная модель «приросла» к основе нерусского происхождения. Суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного) указывает на принадлежность: «чей?» — Ханабеев, то есть сын или потомок человека по прозвищу или имени Ханабей. Сама основа, скорее всего, восходит к тюркским языкам.

Вероятнее всего, в основе лежит сложение двух тюркских корней: «хан» (властитель, правитель) и «бей» (господин, князь). Таким образом, исходное имя или прозвище Ханабей могло означать «хан-бей» или «господин из ханов» — титул, указывающий на высокое положение. Менее вероятна, но возможна версия, что вторая часть восходит к тюркскому «бай» (богач, хозяин), что даёт значение «хан-богач». В любом случае, носитель исходного прозвища выделялся статусом, богатством или властью в своей среде.

Фамилия Ханабеева — женская форма, образованная по стандартной модели: к мужской фамилии Ханабеев добавили окончание -а. Мужской вариант, Ханабеев, встречается чаще и фиксируется в регионах с сильным тюркским влиянием — в Поволжье, на Урале, в Западной Сибири, а также среди татар и башкир. Сословная принадлежность предков могла быть разной: от служилых татар, получавших земли, до крестьян. Однако однозначных документальных подтверждений о принадлежности к конкретному дворянскому роду нет — фамилия остаётся преимущественно народной, крестьянской или мещанской.

В отличие от фамилий, образованных от православных имён, Ханабеева сохраняет яркую восточную окраску. Это не «книжная» фамилия из семинарий, а живое прозвище, закрепившееся в устной традиции. Встречаются варианты написания с одной буквой «е» (Ханабева) или с «а» в конце (Ханабеев), но нормативная форма — через двойное «ее». Для этимолога эта фамилия интересна тем, что демонстрирует, как тюркские титулы переходили в разряд личных имён, а затем — в наследственные фамилии на русской почве.