Фамилия Ханабеев — редкий случай, когда тюркская основа и русский суффикс скрестились не по самому очевидному пути. Обычно фамилии на -ев/-ов указывают на отчество: Иванов — сын Ивана. Здесь же основа «Ханабей» — сложное слово, которое требует разбора по частям, а не простого перевода «сын Ханабея».

Первая часть, «хан», в тюркских языках означает «правитель, государь». Вторая, «бей» (или «бек»), — это титул знати, военачальника или крупного землевладельца. Соединение двух титулов в одном имени — «хан-бей» — встречается у народов Поволжья и Кавказа, но чаще как прозвище или составное личное имя (например, Ханбий, Ханбек). Фонетически «Ханабей» могло возникнуть из формы «Хан-аба» (где «аба» — отец, старший родственник в некоторых тюркских языках) или как стяжение «Хан-бай» (бай — богатый, хозяин). В любом случае, исходное слово обозначало человека, которого в общине называли «князем» или «господином» — не обязательно по крови, возможно, за богатство или властный характер.

Русский суффикс -ев присоединился к основе «Ханабей» по стандартной модели: если имя заканчивается на -ей, фамилия приобретает окончание -ев (сравните: Алексей — Алексеев, Матвей — Матвеев). Таким образом, Ханабеев — это «сын (или потомок) Ханабея». Интересно, что суффикс не тюркский, а чисто русский, что говорит о том, что носитель фамилии или его предки уже жили в русскоязычной среде и фамилия оформлялась по документам приходскими священниками или писцами.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически смешивались тюркские и славянские народы: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область, а также Северный Кавказ. Встречается она редко, и в дореволюционных списках её почти нет — скорее всего, это поздняя фамилия, возникшая в XIX веке, когда крестьянам и мещанам массово присваивали фамилии по имени отца или деда.

Спорных версий здесь немного. Иногда пытаются связать «Ханабей» с арабским «ханафи» (приверженец одного из толков ислама), но это фонетически натянуто: «ханафи» дало бы фамилию Ханафеев, а не Ханабеев. Более правдоподобно, что перед нами именно тюркское составное имя с двумя титулами, которое в быту сократили до более удобного для русского уха варианта.

Никаких известных исторических личностей с фамилией Ханабеев в открытых источниках не зафиксировано — это фамилия простых людей, которые, скорее всего, были крестьянами, казаками или мелкими торговцами в смешанных по этносу областях.