Фамилия Ханбекян — армянская, и это сразу видно по её окончанию. Формант «-ян» (в диалектных вариантах «-янц» или «-енц») — один из самых распространённых патронимических суффиксов в армянском языке. Он указывает на принадлежность к роду: изначально такие фамилии отвечали на вопрос «чей ты?» и означали «из семьи такого-то» или «из рода такого-то». Поэтому Ханбекян поначалу значило «из рода Ханбека».

Сам армянский термин для фамилии — «азганун» — буквально переводится как «имя клана» или «имя рода», что хорошо согласуется с этой моделью образования. Но основа фамилии не армянская, а тюркская. Она образована от мужского имени Ханбек, которое сложилось из двух древнетюркских слов. Первая часть — «хан» — в переводе на русский означает «властитель, монарх». Вторая — «бек» (или «бей») — титул, который в тюркской традиции носили военачальники и родовая знать. По сути, имя Ханбек — это составной титул, подчёркивающий высокое положение: что-то вроде «князь над князьями» или «господин-правитель».

Такое сочетание — армянский патронимический суффикс при тюркской основе — не редкость для народов Закавказья. В регионе веками тесно переплетались армянская и тюркская культуры, и имена, титулы и прозвища свободно переходили из одной языковой среды в другую. Предок, первым получивший имя Ханбек, скорее всего, не был монархом, а носил это имя как знак уважения, возможно, происходя из знатного или военного рода, где такие титулы были в ходу. Фамилия же закрепилась за его потомками уже как родовое имя.

В написании фамилии встречается вариант Ханбекян через «е», но возможны искажения при передаче латиницей или в русской транскрипции, где безударная «е» может звучать как «и». Сама фамилия довольно редкая и несёт яркий отпечаток социального контекста: она напоминает о тех временах, когда имя человека было не просто личным обозначением, а заявлением о его месте в обществе.