Фамилия Хантимер — редкий случай в русском ономастиконе, где тюркская основа срастается с русским суффиксом принадлежности. Вопреки первому впечатлению, перед нами не сложносоставная фамилия вроде «Хан + Тимер», а имя-прозвище, перешедшее в фамилию через патронимическую модель.

Разбираем словообразовательную цепочку. Основа «Хантимер» — это тюркское мужское имя, распространённое у татар, башкир и других тюркоязычных народов. Оно состоит из двух компонентов: «хан» (властитель, правитель) и «тимер» (железо). В буквальном переводе — «железный хан» или «хан-железо». Такие имена-композиты (сравните: Бектимер, Айтимер, Темирхан) в прошлом давали мальчикам с пожеланием крепости, несгибаемости и власти, как у металла. Фамильный суффикс «-ов» (в разговорной речи мог редуцироваться до «-ев» или писаться как «-ов» после твёрдого согласного) указывает на то, что фамилия образована по русской модели отчества: «чей?» — Хантимеров сын, то есть потомок человека по имени Хантимер.

Географически фамилия Хантимеров (а в просторечии, возможно, и Хантимер) привязана к регионам, где издавна жили татары и башкиры, — Поволжье, Приуралье, южный Урал. В дореволюционных документах, особенно в метрических книгах и ревизских сказках, эта фамилия встречается среди крестьян и мещан Казанской, Уфимской, Оренбургской губерний. Интересно, что в некоторых записях XIX века фамилию могли писать слитно, как Хантимеров, или через дефис, если переписчик пытался сохранить тюркское звучание: Хан-Тимеров. Но вариант без суффикса, Хантимер, — это, скорее всего, результат усечения окончания в устной речи или позднейшая фиксация в документах (например, по паспорту), где русский суффикс просто отпал, а основа осталась.

Есть ещё одна версия, менее вероятная, но упоминаемая в некоторых любительских справочниках: связь с названием ханского знамени (от «хан» и «тимер» в значении «стяг»). Однако в тюркских языках слово «тимер» почти повсеместно означает именно железо, а не флаг (для знамени есть другие корни). Поэтому версия с личным именем — основная и подтверждается массой параллельных фамилий (Темиров, Темирханов, Бектимеров). Сословно предки носителя фамилии — скорее всего, крестьяне или мелкие служилые люди (толмачи, казаки), принявшие православие и вместе с ним русскую модель фамилии, но сохранившие тюркское имя предка.