Фамилия Харагезян — армянская по происхождению, что видно по её типичному окончанию «-ян» (в старой орфографии «-янц»). В русском языке она закрепилась в форме Харагезян, хотя исходное армянское произношение ближе к «Харагезян» или «Харагезян». Этот суффикс в армянских фамилиях указывает на принадлежность к роду или потомка: «Харагезян» буквально значит «из рода Харагеза» или «сын Харагеза».

Основа фамилии — личное имя или прозвище Харагез. В армянском языке «хара» (qara) обычно означает «чёрный», а «гез» (gez) — от тюркского «глаз» или «око». Таким образом, Харагез — это «чёрный глаз». Прозвища по цвету глаз или волос были распространены у многих народов, и армяне, жившие в тесном контакте с тюркским миром (особенно в Западной Армении и на Кавказе), нередко заимствовали такие описательные формы. Человек с тёмными, почти чёрными глазами мог получить прозвище Карагёз или Харагез, которое затем закрепилось за его потомками как фамилия.

Есть и вторая, менее вероятная версия: «Харагез» может восходить к названию местности. В исторической Армении существовали топонимы с корнем «Хара-» (например, село Хараба в Карсе). Но в этом случае фамилия скорее звучала бы как Харагезян с другим суффиксальным оформлением. Прозвищное происхождение — самое прямое и логичное.

Фамилия Харагезян не слишком распространена в современной Армении, чаще встречается в диаспоре — среди армян, переехавших в Россию, США, Францию и страны Ближнего Востока. В дореволюционной России армянские фамилии на «-ян» не русифицировали, в отличие от грузинских или тюркских, поэтому фамилия сохранила исходную форму без добавления русских суффиксов «-ов» или «-ин». Носители Харагезян, скорее всего, происходят из западных областей исторической Армении (территория современной Турции), где армянское население было особенно многочисленным до событий начала XX века.

Никаких документальных свидетельств о дворянском происхождении этой фамилии нет — это фамилия ремесленников, крестьян или торговцев, получивших прозвище по внешности. С точки зрения словообразования, фамилия стоит в ряду таких же описательных армянских фамилий, как Карапетян (от имени Карапет, но с другим значением), Ахвердян (от «ахверд» — «чёрная роза») или просто Карагезян (прямой аналог с тюркским «кара»). Харагезян — это фамилия, которая звучит как портрет: чёрные глаза, доставшиеся в наследство от далёкого предка.