Фамилия Хавонова — женская форма фамилии Хавонов, и её разговорный или диалектный характер заметен сразу. В русской ономастике фамилии на -ов/-ев обычно образуются от имён, прозвищ или профессий, оканчивающихся на твёрдый согласный. В основе здесь лежит слово «хавон» или «хавоня», которое не встречается в литературном языке, но хорошо известно в южнорусских и украинских говорах.

Самая вероятная версия связывает фамилию с диалектным глаголом «хавать» — есть, жрать (часто с оттенком грубости или прожорливости). «Хавон» или «хавоня» — это прозвище человека с хорошим аппетитом, любителя поесть, либо того, кто работает с едой: повара, хлебопёка, трактирщика. В некоторых областях так называли человека, который слишком много болтает или хвастает (от «хавать» в переносном смысле — «заглатывать» слова). Менее распространённая, но возможная версия — связь с украинским «хавка» (пища, еда) или «хавтура» (поминки, угощение). Тогда фамилия могла указывать на человека, который кормил людей — например, устроителя обедов на свадьбах и похоронах.

Суффикс -ов в фамилии Хавонов (а значит, и Хавонова) типичен для русской модели: «чей?» — «сын Хавона». Фамилия могла возникнуть в среде крестьян или посадских людей, где прозвища были простыми и бытовыми. В документах XIX века такая фамилия встречается преимущественно в Воронежской, Курской и Ростовской губерниях — на территориях, где говорят на южнорусском наречии и где слово «хавать» было в ходу. В центральных и северных областях фамилия редка.

Форму Хавонова (с ударением на второй или третий слог) носила женщина из семьи Хавоно́вых или Хаво́новых. В отличие от фамилий на -ин, которые часто указывают на принадлежность к матери (например, Марьин), здесь стандартная модель отчества по отцу. Если искать однокоренные фамилии, то это Хавонов, Хавин, Хавкин — все они восходят к той же основе «хав-», но с разными суффиксами. Фамилия Хавонова недвусмысленно говорит о прозвище предка: он был либо едоком, либо кормильцем, и это прозвище закрепилось в роду.