Фамилия Хайбарова — женская форма фамилии Хайбаров, и её происхождение напрямую связано с мужским именем или прозвищем, лёгшим в основу. По наиболее вероятной версии, корень «Хайбар» восходит к арабскому имени Хайбар (Хайбар). В исламской традиции это имя связано с оазисом Хайбар — местностью в Аравии, известной по событиям VII века. Однако в качестве личного имени оно встречается редко, и в России, особенно в регионах с тюркским или мусульманским населением, могло закрепиться как прозвище или патроним. Суффикс «-ов» (в женском роде «-ова») указывает на типичную русскую модель образования фамилий от отчества: Хайбаров буквально означает «сын Хайбара».

Вторая, менее распространённая гипотеза, связывает основу с тюркским словом «хайбар» — в некоторых диалектах так могли называть резкого, упрямого или задиристого человека. В этом случае фамилия образована от прозвища, а не от имени. Обе версии имеют право на существование, но первая — арабско-мусульманская — встречается в ономастических справочниках чаще, так как имя Хайбар (пусть и редкое) фиксируется в антропонимии народов Кавказа и Поволжья.

Географически фамилия Хайбаров (и Хайбарова) характерна для регионов, где исторически сильны тюркские и исламские традиции: Татарстан, Башкортостан, северокавказские республики (особенно Дагестан и Чечня), а также среди азербайджанцев. Встречается она и в Средней Азии, но в русской записи — реже. В центральной России фамилия редкая, что указывает на её локальное происхождение.

Сословно предки носителей фамилии, скорее всего, относились к крестьянам или горожанам, так как фамилия не содержит дворянских суффиксов («-ский», «-цкий») и не связана с известными аристократическими родами. В метрических книгах XIX века Хайбаровы могли записываться как «инородцы» или «мусульмане» — это типично для Поволжья и Кавказа. Ударение в фамилии чаще всего падает на второй слог: Хайба́рова, но в разговорной речи возможны варианты.