Фамилия Хаймахан — редкий случай, когда корень не поддаётся однозначной славянской или тюркской расшифровке с ходу. Скорее всего, перед нами вариант фамилии, образованной от прозвища, которое могло прийти из монгольских или калмыцких языков. В них «хайма» или «хаймаг» означает «скот», «животное», а «хан» — титул правителя. Если сложить эти значения, прозвище Хаймахан могло означать «владелец скота» или «скотный хан» — так в степи могли иронично или уважительно назвать зажиточного скотовода, главу большого стада.

Вторая версия отталкивается от тюркского «хайма» — «мелкий, крошечный» или «нежный». Тогда Хаймахан — это уменьшительно-ласкательное прозвище: «маленький хан», «нежный господин». В этом случае суффикс -ан в конце — не русский, а тюркский, он добавляет значение принадлежности или ласкательности. Фамилия могла закрепиться за младшим сыном в семье или за человеком, которого в шутку называли «ханом» за его мягкий характер.

Географически фамилия Хаймахан встречается у калмыков, бурят и у русских, живших в соседстве с ними — в Астраханской области, Калмыкии, на юге Сибири. Русское окончание -ов или -ин к ней не приросло, что указывает на относительно позднюю фиксацию в документах, уже в XX веке, когда фамилии начали записывать в национальном виде без русификации. Сословно носители — скорее всего, выходцы из крестьян-скотоводов или казаков, которые переняли прозвище от соседей-степняков.

Спорных версий немного: пытаться вывести Хаймахан из немецкого или еврейского корня нет оснований — ни в одном из этих языков нет устойчивого сочетания «хайма» с «ханом». Самая правдоподобная гипотеза — монгольско-калмыцкая, с прозвищем, указывающим на богатство или социальную роль в скотоводческом быту.