Фамилия Хаймульдина — женская форма, мужской вариант — Хаймульдин. В ней сразу заметна нерусская основа: корень «Хаймульд-» явно восходит к тюркским или арабо-тюркским именам. Скорее всего, в основе лежит сложное имя, где первая часть — «хай» (от арабского «хайй» — живой, или тюркского «хай» — господин, богатый), а вторая — «мульд» (искажённое арабское «мульк» — владение, или «маулид» — рождённый). Таким образом, Хаймульдин могло означать «живущий во владении» или «рождённый господином» — типичная для мусульманских имён формула с пожеланием благополучия.

Суффикс «-ин» (а не «-ов») указывает на русскую адаптацию по модели, распространённой в Поволжье и Приуралье. В татарской, башкирской и казахской среде фамилии на «-ин» нередко образовывали от имён отца: Хаймульдин — «сын Хаймульды». Само имя Хаймульда в чистом виде встречается редко, это скорее диалектная или разговорная форма более полного имени (например, Хаймулла — «живой Аллахом»). Фамилия осела в основном в Оренбургской, Челябинской областях и Башкортостане — регионах, где столетиями жили тюркские народы и где русские писцы фиксировали местные имена «на слух», нередко упрощая окончания.

Сословно носители фамилии, вероятнее всего, относились к государственным или ясачным крестьянам, реже — к казачеству. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В дореволюционных метрических книгах Хаймульдины встречаются в записях о рождении детей у мусульман-тептярей и башкир, что подтверждает народное, а не аристократическое происхождение.

Сложно найти фамилию с более редким сочетанием звуков: «Хаймульдин» стоит в одном ряду с такими же нечастыми образованиями, как Хайбуллин или Хайдаров, но отличается от них вторым компонентом. Если Хайбуллин — «раб Аллаха живой», то Хаймульдин — возможно, «живой владелец» или «владеющий жизнью». Спор о точном значении упирается в то, как именно записал имя русский писарь: мог он сократить «Хаймулла» до «Хаймульд» или переделать арабское «Хай аль-Мульк». В любом случае, фамилия прочно привязана к тюркской ономастике Урало-Поволжья и не имеет славянских корней.