Фамилия Хидоятова — женская форма фамилии Хидоятов. Её основа не славянская, а тюркская или персидская, что сразу указывает на географию происхождения: скорее всего, это фамилия из Средней Азии, в частности из Узбекистана или Таджикистана. В русском языке она закрепилась через присоединение стандартного суффикса -ов, который оформляет фамилии по русской модели, но корень остался иноязычным.

Корень «Хидоят» восходит к арабскому слову «хидаят» (هداية), что означает «руководство», «правильный путь», «наставление». В исламской культуре это слово часто входит в состав личных имён, например Хидоят (Хидаят) — имя, которое давали с пожеланием, чтобы человек следовал верному пути. Таким образом, фамилия Хидоятова образована от мужского имени Хидоят (Хидоят-хан, Хидоят-бек и т.п.) по простой модели: имя + патронимический суффикс -ов/-ев, который в русской традиции означает «сын такого-то». Соответственно, Хидоятова — это «дочь (или жена) Хидоята».

В отличие от многих русских фамилий, которые формировались из прозвищ или профессий, здесь мы имеем дело с фамилией-патронимом, заимствованной через переселение или смешение культур. В советское время, когда в Средней Азии массово оформляли фамилии по русскому образцу, многие носители местных имён получали окончания -ов/-ев. Именно тогда имя Хидоят превратилось в фамилию Хидоятов.

Спорных версий здесь немного: слово «хидоят» иногда путают с тюркским «хидо» (подарок), но это ошибочно — арабский корень доминирует. Встречается также написание через «а» — Хидаятова, что связано с разной передачей арабской буквы «айн» в русской транскрипции. Оба варианта возможны, но форма с «о» чаще встречается в узбекской среде, а с «а» — в таджикской.

Фамилия редкая даже для Средней Азии, а в России встречается единично. Её носители, как правило, имеют корни из регионов, где распространён ислам суннитского толка, и в прошлом могли принадлежать к образованным слоям — муллам, учителям или чиновникам, так как имя Хидоят давали людям, от которых ждали наставничества.