Фамилия Хидоятов — один из ярких примеров тюрко-персидского влияния в русском ономастиконе. Она образована от мужского имени Хидоят, которое восходит к арабскому слову «хидаят» (هداية) — «руководство», «верный путь», «божественное наставление». В исламской традиции это имя нередко давали с пожеланием, чтобы ребёнок шёл по праведному пути. Русский суффикс -ов, добавленный к основе, стандартно оформил фамилию по модели «чей?» — потомок Хидоята.

Географически фамилия наиболее характерна для народов Средней Азии, особенно для таджиков и узбеков, у которых арабские имена с персидским произношением исторически распространены. В русской среде она встречается редко и, как правило, у потомков выходцев из этих регионов. В советское время многие носители такой фамилии переезжали в европейскую часть СССР, поэтому сейчас Хидоятовых можно встретить в Москве, Татарстане и Башкортостане.

Любопытная деталь: в отличие от русских фамилий, образованных от канонических имён (Иванов, Петров), фамилия Хидоятов сохраняет прозрачную этимологию исходного слова. Арабский корень «х-д-й» (вести по пути) дал в русском языке заимствования вроде «хиджра» (переселение) и «мухтади» (идущий верным путём), но фамилия Хидоятов осталась единственной в своём роде — она не имеет однокоренных «братьев» в русском списке фамилий, что делает её ономастически изолированной.

В дореволюционных источниках фамилия не фиксируется — она появилась в массовом порядке при паспортизации в 1920–1930-е годы, когда нерусские народы СССР получали фамилии по русской модели. Поэтому сословной принадлежности у неё нет: предки могли быть и ремесленниками, и торговцами, и муллами. Единственное, что объединяет всех носителей — это отсылка к имени, несущему религиозный смысл.