Фамилия Химоненко относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от крестильного имени Ефимий. Имя Химоня представляет собой производную форму имени Ефимий. Оно в переводе с греческого языка означает «благочестивый, благожелательный». В возрасте двадцати девяти лет святой вместе со своим другом Феоктистом удалился от мира и поселился в пещере близ Иерусалима, где впоследствии возникла Ефимиева лавра. Также не исключено, что фамилия Химоненко образована от прозвища Химоня. Оно восходит к диалектному глаголу «химать» со значением «хныкать, плакать». Именование Химоня мог получить капризный или плаксивый ребенок. Поэтому Химоненко буквально понималось как «сын Химона».