Фамилия Хлистовская звучит как типичная «географическая» фамилия, образованная от названия населённого пункта. Её модель — суффикс -ск- плюс окончание -ая — указывает на то, что основателем рода был человек, владевший землёй или происходивший из места с корнем «Хлист-». В русской ономастике такие фамилии чаще всего получали дворяне, но позже их могли носить и выходцы из духовенства, а также крестьяне, переселившиеся из деревни с таким названием.

Корень «Хлист-» неоднозначен. Самое очевидное — связь со словом «хлыст» (прут, кнут). Прозвище Хлыст могли дать человеку резкому, строгому или, наоборот, тонкому и гибкому. Однако есть и другая версия: в южнорусских и украинских говорах «хлист» означало «прут», «лоза», а в некоторых диалектах — «рослый, худой человек». Не стоит путать с религиозным движением хлыстов — это более позднее и узкое значение, которое вряд ли легло в основу фамилии.

География фамилии подсказывает, что искать топоним стоит на западе России или в Беларуси. Деревни с названием Хлисты или Хлистово известны в Смоленской, Псковской и Брянской областях. Фамилия Хлистовская могла возникнуть, когда помещик или священник из села Хлисты получил прозвание по месту службы, а затем его дети закрепили это в фамилии. Вариант с окончанием -ская типичен для польско-литовского влияния, поэтому не исключено, что предки носителя фамилии были шляхтичами или униатскими священнослужителями.

В написании фамилии есть особенность: буква «с» в корне может быть как исконной (от «хлыст»), так и вторичной — от названия села Хлистово, где корень мог звучать как «Хлист-». Спорных версий, вроде связи с немецким «Klist» или тюркским «хлыс», всерьёз рассматривать не стоит — они не подкреплены ни географией, ни словообразовательной логикой. Фамилия редкая, и её носители, скорее всего, ведут род из одного из западнорусских регионов, где до сих пор встречаются деревни с похожими названиями.