Фамилия Хлистун образована от прозвища, и корень у неё — тот самый глагол «хлестать». В старых говорах он звучал как «хлістати» и значил «стегать, сечь, бичевать, бить прутом, хлыстом или кнутом». Отсюда и прямой смысл прозвища: Хлистуном могли назвать человека, чья работа или привычка была связана с хлыстом и кнутом. Проще всего предположить ямщика — возница то и дело стегал лошадей, и это занятие бросалось в глаза окружающим. Но прозвище могло закрепиться и за человеком с крутым, «хлёстким» характером, который не лез за словом в карман и умел ответить так, что мало не покажется.

Однако у глагола было и второе, переносное значение — «врать, пустословить». В этом случае Хлистуном называли болтуна, сплетника или пустобая, который мелет языком без устали. Так что фамилия могла «прилипнуть» к предку не за ремесло, а за манеру говорить. Не исключено и третье прочтение: удалой молодец, острый на язык, бойкий и задорный — его тоже могли окрестить Хлистуном, вложив в прозвище скорее одобрительную, чем осуждающую оценку.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: суффикс -ун в русских прозвищах и фамилиях традиционно указывал на деятеля, склонного к действию, названному основой. Тот же ряд, что и Болтун, Крикун, Молчун. Хлистун — тот, кто хлещет, будь то кнутом, плетью или языком. Фамилия закрепилась в форме без дополнительного суффикса, что типично для украинских и южнорусских фамилий, где прозвище часто переходило в фамилию напрямую.

Точной географической привязки фамилии нет, но по звучанию и словообразованию она тяготеет к южнорусским и украинским говорам, где глагол «хлістати» был в ходу. Известных носителей с громкой исторической биографией среди Хлистунов нет, так что говорить о дворянском или каком-то ином сословном происхождении не приходится — это фамилия простого люда, скорее всего, крестьян или посадских. В любом случае, за ней стоит живое прозвище, которое когда-то точно и метко описывало человека — либо по занятию, либо по языку.