Фамилия Хнытченкова отвечает на вопрос «чей?» и означает «дочь или жена Хнытченко». Это женская форма фамилии Хнытченков, которая, в свою очередь, образовалась от прозвища Хнытча с помощью патронимического суффикса -енк(о), распространенного на украинских землях. Если разобрать цепочку до конца, то корень здесь — глагол «хныкать», то есть «тихо и жалобно плакать», а суффикс -ч- указывает на носителя действия: Хнытча — тот, кто хнычет.

Прозвище Хнытча могло отражать характер основателя рода: плаксивость, робость, чувствительность. Но у него есть и вторая, более глубокая трактовка. В народной среде такие «отрицательные» имена нередко использовали как оберег: родители нарочно называли ребенка Хнытчей, чтобы отвести от него беду. Считалось, что злые силы не позарятся на «плаксу», а настоящий характер мальчика сложится противоположным — веселым и жизнерадостным. Эта версия правдоподобна, поскольку практика охранительных имен широко известна в восточнославянской антропонимии.

Форма Хнытченко указывает на украинское или южнорусское происхождение рода. Первоначально так называли сына Хнытчи — «Хнытченко» буквально значит «маленький Хнытча» или «наследник Хнытчи». Позже, когда носители фамилии оказались в великорусских губерниях, фамилию адаптировали к местной модели: к основе добавили русский суффикс -ов, получив Хнытченков. Женская форма Хнытченкова закрепилась стандартно — как указание на принадлежность женщине из этого рода.

Стоит оговориться: версия о «переезде рода в Россию» — лишь предположение. Фамилия могла возникнуть и на стыке культур, где украинская модель сочеталась с русской. Важнее другое: Хнытченкова — редкий пример фамилии, в которой сохранилась живая экспрессивная основа. В отличие от фамилий от крестильных имен, она несет отпечаток бытовой речи, где слово «хныкать» звучало естественно и понятно каждому.

В документах фамилия встречается в написании с одной «н» — Хнытченкова, что соответствует правилам русской орфографии. Встречаются также варианты Хнытченко (без наращения -ов) и Хнытченков, но все они восходят к одному прозвищному корню.