Фамилия Ходибоев — наглядный пример того, как по суффиксу можно безошибочно определить не только происхождение, но и национальную принадлежность носителя. Формант -ев в сочетании с основой выдает фамилию, сформированную в среде, где русская модель патронимии наложилась на тюркское или иранское имя. В данном случае перед нами фамилия узбекского или таджикского корня, распространенная в Средней Азии.

В основе лежит личное имя Ходибой. Первая часть, «Ходи», восходит к арабскому «хади» — «ведущий», «направляющий», один из эпитетов пророка. Вторая часть, «бой», в тюркских языках означает «богатый», «господин», «хозяин». Сложносоставное имя Ходибой, таким образом, можно перевести как «богатый наставник» или «господин-руководитель». Такие имена-композиты были популярны в дореволюционной Средней Азии, где родители, давая имя, закладывали в него пожелание благополучия и уважения.

Суффикс -ев, а не национальный -ов, указывает на то, что фамилия оформлялась уже в русской административной традиции, скорее всего, в конце XIX — начале XX века, при переписях и паспортизации. Фонетически основа на мягкий согласный (Ходибой) требовала именно суффикса -ев, что отличает эту фамилию от, скажем, Ходибоев, если бы основа произносилась как Ходибай.

Социальный контекст тоже прочитывается: имя Ходибой не было крестьянским или ремесленным. Оно тяготело к среде грамотных людей, возможно, мелких чиновников, учителей при мактабах или купцов. Предок носителя фамилии, скорее всего, был человеком заметным в своей общине — не обязательно богатым в прямом смысле, но тем, к кому шли за советом, «ведущим» в делах.

С точки зрения словообразования фамилия прозрачна и не имеет спорных версий. Это типичная «сыновья» фамилия: Ходибоев буквально значит «сын Ходибоя». Встречаются варианты написания с одной «б» (Ходибоев) и с двумя (Ходдибоев), но второй вариант — результат позднейшей путаницы, а не исторической нормы.