Фамилия Ходжибоева — женская форма фамилии Ходжибоев, которая образована по самой распространённой в русском языке модели: к основе мужской фамилии добавляется окончание -а. Но её корни уходят не в славянскую, а в тюркскую и арабо-персидскую среду.

В основе фамилии лежит слово «ходжи» (или «ходжа»), которое происходит от арабского «хаджи» — титул, который получал мусульманин, совершивший паломничество (хадж) в Мекку. В Средней Азии, на Кавказе и в Поволжье это слово со временем стало не только религиозным титулом, но и уважительным обращением к старшему, наставнику или состоятельному человеку. Иногда «ходжа» входило в состав имён собственных, например, Ходжибай или Ходжибек.

Вторая часть фамилии — «бой» (в русской передаче «боев») — тюркского происхождения и означает «господин», «хозяин», «богатый человек». В Средней Азии «бой» часто добавляли к имени как почётный компонент, указывающий на высокое социальное положение или достаток. Таким образом, имя Ходжибой буквально переводится как «господин-паломник» или «богатый хаджи».

Фамилия Ходжибоева, скорее всего, сформировалась в среде узбеков, таджиков или других народов Центральной Азии, где была распространена традиция образования фамилий от личных имён с добавлением русского патронимического суффикса -ев. Это произошло в советский период, когда в республиках начали массово фиксировать фамилии по русскому образцу. Поэтому предки носительницы фамилии могли быть уважаемыми людьми в своей общине — религиозными деятелями, купцами или зажиточными землевладельцами, чей статус отразился в самом имени.

Интересная деталь: в отличие от многих славянских фамилий, где суффикс -ев указывает на отчество («чей сын»), здесь он просто оформляет тюркское имя в русскую фамилию. В оригинале, без русификации, родовая принадлежность передавалась бы иначе — через окончание -зода (персидское «рождённый от») или -оглы (тюркское «сын»).