Фамилия Ходжиметова — женская форма мужской фамилии Ходжиметов. В основе лежит имя Ходжимет, которое, в свою очередь, восходит к двум арабским или тюркским компонентам: «ходжа» и «мет».

«Ходжа» — широко распространённый в исламском мире титул, который в разные эпохи означал господина, купца, наставника или человека, совершившего паломничество в Мекку. Вторая часть имени — «мет» — вероятно, является сокращением от арабского имени Мухаммад (восхваляемый). Таким образом, Ходжимет — это сложносоставное имя, которое можно перевести как «господин, подобный Мухаммаду» или «почтенный Мухаммад». Встречаются и варианты написания этой основы: Ходжамет, Хожамет.

Модель образования фамилии типична для тюркских народов, особенно для узбеков, таджиков, казахов и крымских татар: к личному имени прибавляется русский суффикс -ов/-ев, указывающий на принадлежность. Ходжиметов — буквально «сын Ходжимета». Женский вариант на -а — Ходжиметова — указывает на то, что носительница является дочерью или женой человека с такой фамилией.

Фамилия не относится к числу древних русских дворянских родов. Её носители — потомки людей, которые в XIX–XX веках получили фамилию по имени отца или деда. Поскольку имя Ходжимет давалось в семьях, где ценили религиозное образование и уважение к старшим, предки современных Ходжиметовых могли быть муллами, учителями, зажиточными ремесленниками или торговцами. Встречается фамилия преимущественно в Средней Азии и в регионах России с компактным проживанием тюркских народов — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области.