Фамилия Холомейдо звучит нехарактерно для русского уха, и это не случайно: её происхождение ведёт в греческую или украинскую среду, а точнее — в причерноморские регионы, где столетиями смешивались языки и культуры. Основа фамилии — прозвище или имя Холомей (Холомей), которое, скорее всего, восходит к греческому «холос» (целый, здоровый) или к диалектному украинскому «холомій» — так в некоторых говорах называли человека невысокого роста, коренастого, «коротышку». Суффикс -ейдо — характерный греческий патронимический показатель («сын такого-то»), который через крымских греков или греков Приазовья попал в фамилии восточных славян. Таким образом, Холомейдо буквально означает «сын Холомея» или «потомок человека по прозвищу Холомей».

Встречается фамилия в основном на юге Украины и в Краснодарском крае России — там, где селились греки-понтийцы и украинцы. В русских переписях и метрических книгах XVIII–XIX веков её почти нет, что подтверждает позднее (по историческим меркам) закрепление в письменной традиции. Интересно, что написание с финальным «о» (Холомейдо, а не Холомейда) указывает на влияние украинской орфографии, где окончание -о в фамилиях нередко.

Споров вокруг корня немного: версия о греческом происхождении выглядит убедительнее, чем попытки связать фамилию с русским «холм» или «холоп». В пользу греческой гипотезы говорит не только суффикс, но и география бытования — фамилия компактно локализована в зоне греческих колоний Северного Причерноморья. Если предки носителя были не греками, а украинцами, то прозвище могло закрепиться за человеком невысокого, плотного телосложения. В любом случае, фамилия Холомейдо — яркий пример того, как через суффикс и окончание можно прочитать миграционный маршрут семьи.