Фамилия Холшевников образована от прозвища или имени Холшевник. Слово «холшевник» в русских говорах — не ремесло и не профессия, а название растения. В словаре Владимира Даля «холшевник» или «холщовник» — это кустарник, разновидность жимолости, татарская жимолость. В некоторых областях так называли и крушину ломкую. Человек мог получить прозвище Холшевник за то, что жил в зарослях этого кустарника, занимался его сбором или просто внешне ассоциировался с этим растением — например, был суховат и жилист, как ветка холшевника.

Основа фамилии — «холш-», а не «холщ-». Это важно: написание через «е» после «ш» указывает на южнорусское или среднерусское происхождение, где «е» звучало как «ё» или «о» после шипящих. В северных и московских говорах чаще говорили «холщовник», а на юге и востоке — «холшевник». Таким образом, фамилия Холшевников закрепилась в той форме, которая была характерна для рязанских, тамбовских или воронежских земель.

Суффикс «-ник» в основе указывает на лицо по признаку: холшевник — тот, кто имеет отношение к холшевнику. Затем прибавился типичный русский суффикс «-ов», образующий притяжательные фамилии: «чей сын?» — Холшевников. Такая модель — самая массовая в русской ономастике, но именно редкая растительная основа выделяет эту фамилию среди тысяч «ремесленных» и «животных» фамилий.

Сословно Холшевниковы, скорее всего, крестьяне или однодворцы. Дворянских родов с такой фамилией в гербовниках нет, и в списках служилых людей XVI–XVII веков она не встречается. Это фамилия «поздняя», кристаллизовавшаяся в XVIII–XIX веках, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам. Географически она и сегодня сосредоточена в основном в Центральной России и Поволжье, что подтверждает её почвенное, а не книжное происхождение.