Фамилия Холшевникова — женская форма мужской фамилии Холшевников. Её основа — прозвище или профессиональное именование Холшевник. Чтобы понять, откуда оно взялось, нужно заглянуть в старые русские говоры и ремёсла.

Самый вероятный корень — слово «холщ(е)вник». Так в некоторых регионах называли мастера, который ткал или торговал холстом — грубой льняной тканью. Холщевник мог быть ремесленником, работающим на дому, или мелким торговцем на ярмарке. Суффикс -ник в основе указывает на человека по роду занятий, а фамильный суффикс -ов/-ев превратил прозвище в наследственное имя: Холшевников — сын Холшевника. Чередование «щ/ш» в корне (холщ-евник → холш-евник) — типичное для русской диалектной фонетики упрощение, когда шипящий звук «щ» переходил в более твёрдый «ш» в быстрой речи.

Менее убедительная, но возможная версия — связь с личным именем Холшев, которое могло быть производной формой от какого-либо крестильного имени (например, от Феофилакт или Евфимий через народные варианты). Однако в ономастике профессиональная основа для фамилий с таким суффиксом встречается гораздо чаще, чем гипотетическое прозвище от редкого имени.

Географически фамилия Холшевников (и её женская форма) тяготеет к центральным и северным областям России, где было развито домашнее ткачество. Встречается она нечасто, что характерно для фамилий, образованных от узких местных ремёсел. В дореволюционных источниках носители такой фамилии чаще всего принадлежали к крестьянскому или мещанскому сословию — людям, чьё прозвище точно описывало их повседневное занятие.