Фамилия Хомкин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Хомкин послужило церковное имя Фома. Имя Хомка, скорее всего, представляет собой производную форму имени Хома - украинского аналога Фома, которое в переводе с греческого означает «близнец». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Хомка, со временем получил фамилию Хомкин. О точном месте и времени возникновения фамилии Хомкин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Хомкин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.