Фамилия Хомкины образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии послужило церковное имя Фома. Имя Хомка, скорее всего, представляет собой производную форму имени Хома — украинского аналога Фома, которое в переводе с греческого означает «близнец». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Хомка, со временем получил фамилию Хомкин. О точном месте и времени возникновения фамилии Хомкины в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Хомкины представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.

Если копнуть глубже, то модель образования здесь простая и показательная: суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть «сын Хомки». Это типичный патроним, каких много в русском ономастиконе. Интересно, что имя Хома, от которого пошла уменьшительная форма Хомка, в старину бытовало не только на Украине, но и в южнорусских говорах, где «ф» часто заменяли на «х» — так Фома превращался в Хому. Поэтому фамилию Хомкины можно смело считать южнославянским или малороссийским следом в русской культуре. Сравните с однокоренными фамилиями Хомин, Хоменко, Хомяков — все они растут из одного корня, но разошлись по разным регионам. В отличие от более редких вариантов, Хомкины встречаются и в центральной России, что говорит о миграции носителей имени с юга на север. Сегодня фамилия не слишком частая, но и не исчезающая — её можно встретить в документах и в повседневной жизни, что делает её живым напоминанием о том, как народная речь перекраивала церковные имена на свой лад.