Фамилия Хомош — редкий случай, когда прозвище почти наверняка связано с внешностью или манерой поведения, а не с ремеслом или именем предка. В её основе лежит украинское или южнорусское слово «хомоша» — так в некоторых говорах называли неуклюжего, медлительного человека, увальня. Корень тот же, что и в диалектном «хомошить» (медленно возиться, копаться). Человек, получивший такое прозвище, вероятно, не отличался расторопностью — в крестьянском быту это становилось заметной чертой и легко закреплялось в качестве семейного имени.

Суффикс -ош- в фамилии Хомош — нестандартный для русской модели. Обычно фамилии на -ов, -ин, -ский образуются от полных форм, а здесь мы видим прозвищную основу, оформленную нулевым окончанием. Такая модель (Хомош, а не Хомошев) характерна для украинской и белорусской традиции, где фамилии часто застывали в форме чистого прозвища без патронимического суффикса. Это указывает на вероятное происхождение рода из западнорусских земель или с украинского Левобережья.

Версия о связи с ивритским именем Хомош (от «хомеш» — пять) или с венгерским «хомош» (песок) — натяжка. Для восточнославянской антропонимии первично бытовое значение, а не библейские или иноязычные корни. Если бы фамилия была заимствованной, она бы сохранила иную огласовку или получила типичный славянский суффикс.

В дореволюционных источниках фамилия Хомош встречается крайне редко, преимущественно в метрических книгах Черниговской и Полтавской губерний. Носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами — фамилия не получила дворянского оформления и не попала в родословные книги. Сегодня её можно встретить в России, на востоке Украины и в среде потомков переселенцев в Сибири, но численность рода остаётся небольшой.