Фамилия Хоновец — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все остальные версии. В её основе лежит топоним, а не личное имя или прозвище. Суффикс -ец указывает на выходца из определённого места: так образовывались названия жителей городов и сел (москвич — московец, ростовец, смоленец). Хоновец — это человек, который родом из населённого пункта с корнем Хон-.

Таких пунктов в Восточной Европе несколько. Самый вероятный кандидат — село Хоново (или Хоновичи) на территории современной Беларуси или западной Украины, где фамилии на -ец распространены шире, чем в центральной России. Менее вероятно, но возможно происхождение от польского или чешского топонима Chonów (Хонув). В любом случае, первый носитель фамилии получил её не по имени отца, а по месту, откуда пришёл: «Хоновец» значило «пришелец из Хонова».

Суффикс -ов- в середине фамилии — это притяжательный элемент, который встроился в топоним. Изначальное название села, скорее всего, образовано от имени или прозвища первого поселенца: Хон. Это может быть сокращённая форма от Хонорат или Хонорий (латинские имена, редкие в славянской среде), либо прозвище, связанное с диалектным словом «хон» — в некоторых говорах так называли хорька или куницу. То есть Хоновец — это «житель Хонова», а Хонов — «поселение человека по прозвищу Хон (Хорёк)».

В отличие от массовых фамилий на -ов/-ев, модель на -ец осталась малочисленной и локальной. Хоновец — не крестьянская фамилия в привычном смысле, а скорее именование по месту выхода, которое закрепилось за семьёй пересленца. Встречается она крайне редко, в основном у потомков выходцев из Западного края Российской империи. О сословном составе носителей судить трудно: среди Хоновцов могли быть и мещане, и крестьяне, и шляхта — топонимическая фамилия не даёт подсказки о социальном статусе основателя рода.