Фамилия Хошафов — редкий пример, где основа явно не славянская, а модель оформления — русская. Суффикс -ов указывает на то, что перед нами типичная русская патронимическая фамилия, то есть образованная от имени или прозвища предка по отцу. Вопрос упирается в корень «Хошаф».

Самая вероятная версия связывает фамилию с еврейскими корнями, а именно с идишем или ивритом. В идише есть слово «хошев» (חושב) — «думающий», «мыслящий», «счетовод». В иврите тот же корень (חשב) означает «думать», «вычислять», «считать». Таким образом, Хошафов — это русифицированная форма фамилии, произошедшей от прозвища Хошаф, которое могли дать человеку с аналитическим складом ума, бухгалтеру, счетоводу или просто рассудительному человеку. Фонетически переход «Хошав» в «Хошаф» на русской почве объясним: глухой «ф» на конце — результат оглушения звонкого «в» в позиции конца слова, что закрепилось на письме.

Менее вероятна, но не исключена версия, связывающая фамилию с тюркскими языками. В некоторых тюркских наречиях есть слова, близкие по звучанию, например, «хоша» (приятный, хороший) или «хошаф» (компот, сладкое блюдо из сухофруктов, слово, заимствованное из персидского). В этом случае прозвище могло относиться либо к сладкоежке, либо к торговцу восточными сладостями и напитками. Однако эта версия слабее: оформление таких основ суффиксом -ов в тюркской среде встречается, но реже, и обычно даёт фамилии с ударением на последний слог (Хошафо́в), тогда как в фамилии Хошафов ударение, скорее всего, падает на второй слог — Хоша́фов, что ближе к еврейской огласовке.

Географически фамилия Хошафов встречается в России и странах бывшего СССР, преимущественно в регионах, где исторически были значительные еврейские общины (западные области, Украина, Белоруссия, а также крупные города). В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках эта фамилия, вероятно, фиксировалась в искажённых вариантах — Хошавов, Хашафов, — пока не устоялось современное написание.

Итак, носители фамилии Хошафов, скорее всего, потомки еврейского предка по имени или прозвищу Хошаф (Хошев), что означало «мыслитель» или «счетовод». Суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформилась уже в русскоязычной среде, вероятно, в XIX — начале XX века, при переходе от отчества к наследственной фамилии.