Фамилия Ховерко образована от прозвища Ховер. Оно ведет свое начало от еврейского нарицательного «ховер» («хавер»), которое в переводе на русский язык означает «товарищ, член организации». Кандидат в хаверы назывался нееман («доверенный»), он проходил период подготовки и испытания и затем заявлял о готовности взять на себя обязанности хавера. На первой стадии подготовки кандидату следовало «отделять десятину от того, что он ест, продает и покупает»; на следующей стадии он должен был омывать руки перед едой и перед прикосновением к ритуально чистой пище; на завершающей стадии кандидат уже выполнял все правила ритуальной чистоты. Хавером мог стать любой человек, включая женщин и рабов. Вероятно, прозвище Ховер содержало указание на род занятий основателя фамилии. Так, наличие в фамилии Ховерко суффикса -ко указывает на то, что она сформировалась под славянским влиянием и принадлежит еврейскому роду, основатель которого проживал на территории Украины.