Эта фамилия — редкий пример того, как народная ирония и крепкое словцо закрепились в официальном родовом имени. В основе лежит прозвище, составленное из двух корней: «хрен» (растение или бранное слово) и «пердеть» (испускать газы). Вместе это звучит как грубоватая, но точная характеристика человека — скорее всего, сварливого, въедливого, «ядрёного» на язык, от которого окружающим было «несладко». В русских говорах слово «хрен» нередко означало не только огородную культуру, но и нечто едкое, неприятное, а «пердовать» — издавать резкие звуки. Прозвище могли дать зануде, склочнику или человеку с дурным характером, который «доставал» всех вокруг.

Суффикс -ск- и окончание -ий указывают на то, что фамилия образована по польско-украинской или шляхетской модели. Такие фамилии на -ский/-цкий в XVII–XVIII веках часто получали выходцы из Речи Посполитой, попавшие на русскую службу, или крестьяне, которым помещик давал «благородное» окончание в насмешку. Возможно, предок носителя был однодворцем (служилым человеком на южных рубежах) или мелким шляхтичем, чья фамилия изначально звучала как Хренопердовский, а со временем смягчилась до современного варианта.

Встречается фамилия крайне редко. По данным современных телефонных справочников и баз, единичные носители живут на юге России и в Восточной Украине — в тех краях, где смешивались русские, украинские и польские говоры. Не исключено, что первоначально прозвище звучало иначе: Хренопердый или Хреноперд, а фамилия возникла уже как вторичная, «облагороженная» форма.

Близкие по смыслу фамилии — Хренов, Хренников, Пердов, Пердунов — встречаются чаще, но именно Хренопердованский выделяется своей откровенностью. В дореволюционных метрических книгах её почти нет: вероятно, священники при записи смягчали или заменяли её на более благозвучные варианты (Хреновский, Хренопольский). В современном русском языке фамилия звучит как анекдот, но для её носителей это реальное родовое имя, которое, скорее всего, передавалось по мужской линии с XVII–XVIII веков.