Фамилия Худоконенко напрямую указывает на отца: в её основе лежит мирское имя Худоконь, а суффикс -енко, типичный для украинской и южнорусской традиции, означает «сын». То есть Худоконенко — это буквально «сын Худоконя». Такая модель образования фамилий была особенно распространена в Левобережной Украине, на Слобожанщине и в южных русских землях, где прибавление -енко к имени или прозвищу отца закреплялось за потомками.

Имя Худоконь сложилось из словосочетания «худой конь». Здесь прилагательное «худой» употреблено в старинном значении «неладный, негодный, дурной, плохой», а не в смысле «тощий». На первый взгляд прозвище звучит обидно, но за ним стоит древний обычай охранительных имён. У славян верили, что злые силы не позарятся на ребёнка с плохим именем, поэтому нарочно давали детям имена с противоположным значением: называли Худоконем, желая на самом деле достатка и удачи. Считалось, что такой ребёнок вырастет счастливым и будет жить в довольстве, а имя послужит оберегом от сглаза и несчастий.

Отдельного внимания заслуживает образ коня. В народной культуре конь — одно из самых мифологизированных животных, он связывал мир людей с миром сверхъестественного и участвовал в культе плодородия. Поэтому имя Худоконь звучало не как насмешка, а как сложный оберег, где «худой» (плохой) конь на самом деле должен был притянуть к семье благополучие и здоровье.

Правописание фамилии устойчиво сохраняет корень Худокон-, хотя в устной речи иногда встречается путаница с фамилиями типа Худокормов или Худоногов — все они образованы от аналогичных «охранительных» прозвищ. Но Худоконенко стоит особняком именно благодаря ясной связи с конём и суффиксу -енко, который сразу выдаёт регион происхождения рода. Если ваш предок носил эту фамилию, с высокой долей вероятности он происходил из украинских или южнорусских казачьих земель, где подобные именования были особенно популярны.