Фамилия Худжабеков — яркий пример восточного имени, превратившегося в русскую фамилию. Её основа — составное мусульманское имя Худжабек, где первая часть «худжа» (араб. ходжа, ходжа) означает «господин», «хозяин», «наставник» или «почтенный человек», а вторая — «бек» (тюрк.) — титул знатного лица, князя или военачальника. Таким образом, имя Худжабек можно перевести как «господин-бек» или «почтенный правитель» — двойной титул, подчёркивающий высокий социальный статус носителя.

Словообразовательная модель типична для народов Кавказа и Средней Азии, оказавшихся в составе Российской империи: к тюркскому или арабскому имени добавляли русский суффикс -ов, превращая его в фамилию по отцу. Это произошло в XIX — начале XX века при переписях и паспортизации. Фамилия не получила широкого распространения по всей России, её география сосредоточена в регионах с тюркским и кавказским населением — в Дагестане, Чечне, Азербайджане, а также среди татар и башкир.

Интересная деталь: в отличие от многих «беко-фамилий» (например, Беков, Бекмурзаев), где суффикс -ов просто русифицирует титул, здесь в основе лежит полное двухкоренное имя. Это указывает на то, что предок носителя не просто был беком, а имел двойной почётный титул, что встречалось реже. Встречаются варианты написания Худжабеков и Ходжабеков — разница в передаче арабского звука «х» на русский язык, но суть одна.

О сословии носителей фамилии можно говорить лишь предположительно: имя Худжабек давали детям в знатных или духовных семьях, но со временем фамилия могла перейти и к потомкам ремесленников или крестьян, получивших её от предка-уважаемого человека. Однозначных сведений о массовом дворянстве Худжабековых нет — скорее всего, это фамилия свободных общинников или служилых людей на Кавказе.